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James Fraser e 1 other author revisaram On-target mutations confer resistance to WRN helicase inhibitors in Microsatellite Unstable Cancer Cells
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James Fraser e Sofia Bali revisaram Anticipating on-target resistance to WRN inhibitors in microsatellite unstable cancers
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James Fraser, Karson Chrispens e 1 other author revisaram Density-guided AlphaFold3 uncovers unmodelled conformations in β 2 -microglobulin
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Andres Olavarrieta Colasurdo, James Fraser, Brian Cheung e Varvara Shvareva revisaram De novo design of protein nanoparticles with integrated functional motifs
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Andoni I Asencor, Jonah Frazier, James Fraser e Brian Cheung revisaram Towards pharmacokinetic profile predictions for monoclonal antibodies using sequence based machine learning derived parameters and compartmental modeling
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Barbara S. Perez, James Fraser, Parmis Abdoli e 1 other author revisaram Fung-AI: An AI/ML-driven pipeline for antifungal peptide discovery
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Bivas Nag, James Fraser, Jane E. Oberhauser e Brian Cheung revisaram TissueFormer: Extending single-cell foundation models to predict population-level phenotypes
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Beau Lonnquist, Adam Fillion, James Fraser e Brian Cheung revisaram Zero-shot design of a de novo metalloenzyme
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James Fraser e ziyue zou revisaram DeepDOX1: A Dual-Drive Framework Integrating Deep Learning and First-Principles Physics for Drug-Protein Affinity Prediction
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Sofia Bali, Alexander, Alex Tong e James Fraser revisaram PathDiffusion: modeling protein folding pathway using evolution-guided diffusion
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James Fraser e 1 other author revisaram X-ray Crystallography-Guided Design and Synthesis of Cyclopentyl Heteroaryl Carboxylic Acid based Inhibitors of the SARS-CoV-2 Nsp3 Macrodomain (Mac1)
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James Fraser e Joseph Bondy-Denomy revisaram Generative design of novel bacteriophages with genome language models
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James Fraser, Stephanie A. Wankowicz e Karson Chrispens revisaram AlphaFold as a Prior: Experimental Structure Determination Conditioned on a Pretrained Neural Network
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Gyuna, James Fraser, JINGYOU RAO e 1 other author revisaram Distinct energetic blueprints diversify function of conserved protein folds
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CJ San Felipe, James Fraser e 1 other author revisaram The temperature dependence of binding entropy is a selective pressure in protein evolution
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Karson Chrispens, Isaiah Hazelwood e James Fraser revisaram Have protein-ligand cofolding methods moved beyond memorisation?
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Karson Chrispens, Stephanie A. Wankowicz e James Fraser revisaram Boltz-2: Towards Accurate and Efficient Binding Affinity Prediction
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Nikhil Gupta, James Fraser e 2 other authors revisaram Oligomerization enables the selective targeting of intrinsically disordered regions by small molecules
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Isaiah Hazelwood, James Fraser, Willow Coyote-Maestas e 1 other author revisaram Energetic and structural control of polyspecificity in a multidrug transporter
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Karson Chrispens e James Fraser revisaram InterPLM: Discovering Interpretable Features in Protein Language Models via Sparse Autoencoders
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James Fraser, Rishav Mitra e Priyanka Bajaj revisaram Computational enzyme design by catalytic motif scaffolding
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CJ San Felipe, James Fraser e Jessica Flowers revisaram Heterogeneity in ligand-bound TRPV1: A comparison of methods in cryo-EM and molecular dynamics simulation
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James Fraser, Jessica Flowers e 1 other author revisaram Seeing Double: Molecular dynamics simulations reveal the stability of certain alternate protein conformations in crystal structures
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James Fraser e ziyue zou revisaram Effects of residue substitutions on the cellular abundance of proteins
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James Fraser revisou Probing the modulation of enzyme kinetics by multi-temperature, time-resolved serial crystallography
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James Fraser revisou Bioorthogonal labeling of chitin in pathogenic Candida species reveals biochemical mechanisms of hyphal growth and homeostasis
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James Fraser e Avi J. Samelson revisaram Massively parallel genetic perturbation reveals the energetic architecture of an amyloid beta nucleation reaction
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James Fraser, Jessica Flowers e 1 other author revisaram Unveiling Cas8 Dynamics and Regulation within a transposon-encoded Cascade-TniQ Complex
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James Fraser, Luisa Vasconcelos, Liyi Cheng, Samantha Lish, S. Chan Baek, Lang Ding, Alexandra Probst, Naiya Phillips, William Grubbe, Youchen Guan e 2 other authors do HHMI Transparent and Accountable Peer Review Training Program revisaram Virion morphology and on-virus spike protein structures of diverse SARS-CoV-2 variants
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Christian Macdonald, James Fraser, David Byun e Jeffrey Zheng revisaram The herbicide acetochlor causes lipid peroxidation by inhibition of glutathione peroxidase 4
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Christian Macdonald, James Fraser, Ivan Chavez, Dani Rodea e Ashraya Ravikumar revisaram Decoding the Cure-all Effects of Ginseng
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Stephanie Wankowicz, Lena Bergmann e James Fraser revisaram The mineralocorticoid receptor forms higher order oligomers upon DNA binding
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Christian Macdonald e James Fraser revisaram The conserved protein CBA1 is required for vitamin B 12 uptake in different algal lineages
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Christian Macdonald, James Fraser, Zhengya Liu e Catherine Shin revisaram Phosphorylation of pyruvate dehydrogenase marks the inhibition of in vivo neuronal activity
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Christian Macdonald, James Fraser e Sonya Lee revisaram Higher-order epistasis creates idiosyncrasy, confounding predictions in protein evolution
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