- علم الأحياء الجزيئي
- نُشرت المراجعة
- خادم المسودات البحثية الأولية
- bioRxiv
James Fraser
- ORCID iD
- 0000-0002-5080-2859
مراجعات PREreview
-
ziyue zou وJames Fraser وSofia Bali راجعوا Combining Stability-Centered Atomistic Design with Machine Learning for Targeted Enzyme Optimization -
James Fraser و1 مؤلف آخر راجعوا On-target mutations confer resistance to WRN helicase inhibitors in Microsatellite Unstable Cancer Cells - علم الأورام
- علم الأمراض والطب الشرعي
- علم الأحياء الجزيئي
- نُشرت المراجعة
- خادم المسودات البحثية الأولية
- bioRxiv
-
James Fraser وSofia Bali راجعوا Anticipating on-target resistance to WRN inhibitors in microsatellite unstable cancers - نُشرت المراجعة
- خادم المسودات البحثية الأولية
- bioRxiv
-
James Fraser وKarson Chrispens و1 مؤلف آخر راجعوا Density-guided AlphaFold3 uncovers unmodelled conformations in β 2 -microglobulin - كيمياء المواد
- علم الأحياء الجزيئي
- علم الوراثة
- نُشرت المراجعة
- خادم المسودات البحثية الأولية
- bioRxiv
-
Andres Olavarrieta Colasurdo وJames Fraser وBrian Cheung وVarvara Shvareva راجعوا De novo design of protein nanoparticles with integrated functional motifs - علم الأحياء الجزيئي
- علم البيئة
- علم الأحياء البنيوي
- نُشرت المراجعة
- خادم المسودات البحثية الأولية
- bioRxiv
-
Andoni I Asencor وJonah Frazier وJames Fraser وBrian Cheung راجعوا Towards pharmacokinetic profile predictions for monoclonal antibodies using sequence based machine learning derived parameters and compartmental modeling - الأشعة, الطب النووي والتصوير الطبي
- علم الأحياء الجزيئي
- نُشرت المراجعة
- خادم المسودات البحثية الأولية
- bioRxiv
-
Barbara S. Perez وJames Fraser وParmis Abdoli و1 مؤلف آخر راجعوا Fung-AI: An AI/ML-driven pipeline for antifungal peptide discovery - علم الأحياء الدقيقة
- علم الأدوية
- علم الأحياء الجزيئي
- نُشرت المراجعة
- خادم المسودات البحثية الأولية
- bioRxiv
-
Bivas Nag وJames Fraser وJane E. Oberhauser وBrian Cheung راجعوا TissueFormer: Extending single-cell foundation models to predict population-level phenotypes - علم الأحياء الجزيئي
- الفيزياء الحيوية
- نُشرت المراجعة
- خادم المسودات البحثية الأولية
- bioRxiv
-
Beau Lonnquist وAdam Fillion وJames Fraser وBrian Cheung راجعوا Zero-shot design of a de novo metalloenzyme - الطاقة المتجددة، الاستدامة والبيئة
- الكيمياء العضوية
- علم الأحياء الجزيئي
- نُشرت المراجعة
- خادم المسودات البحثية الأولية
- bioRxiv
-
James Fraser وziyue zou راجعوا DeepDOX1: A Dual-Drive Framework Integrating Deep Learning and First-Principles Physics for Drug-Protein Affinity Prediction - النظرية الحاسوبية والرياضيات
- علم الأحياء الجزيئي
- نُشرت المراجعة
- خادم المسودات البحثية الأولية
- bioRxiv
-
Sofia Bali وAlexander, Alex Tong وJames Fraser راجعوا PathDiffusion: modeling protein folding pathway using evolution-guided diffusion - علم الأحياء الجزيئي
- الفيزياء الذرية والجزيئية والبصريات
- الرياضيات الحاسوبية
- نُشرت المراجعة
- خادم المسودات البحثية الأولية
- bioRxiv
-
James Fraser و1 مؤلف آخر راجعوا X-ray Crystallography-Guided Design and Synthesis of Cyclopentyl Heteroaryl Carboxylic Acid based Inhibitors of the SARS-CoV-2 Nsp3 Macrodomain (Mac1) - علم الأحياء الجزيئي
- الكيمياء العضوية
- نُشرت المراجعة
- خادم المسودات البحثية الأولية
- ChemRxiv
-
James Fraser وJoseph Bondy-Denomy راجعوا Generative design of novel bacteriophages with genome language models - علم البيئة
- علم الأحياء الجزيئي
- نُشرت المراجعة
- خادم المسودات البحثية الأولية
- bioRxiv
-
James Fraser وStephanie A. Wankowicz وKarson Chrispens راجعوا AlphaFold as a Prior: Experimental Structure Determination Conditioned on a Pretrained Neural Network - علم الأحياء الجزيئي
- كيمياء المواد
- الفيزياء الذرية والجزيئية والبصريات
- نُشرت المراجعة
- خادم المسودات البحثية الأولية
- bioRxiv
-
Gyuna وJames Fraser وJINGYOU RAO و1 مؤلف آخر راجعوا Distinct energetic blueprints diversify function of conserved protein folds - علم الأحياء الجزيئي
- علم الوراثة
- نُشرت المراجعة
- خادم المسودات البحثية الأولية
- bioRxiv
-
CJ San Felipe وJames Fraser و1 مؤلف آخر راجعوا The temperature dependence of binding entropy is a selective pressure in protein evolution - علم الأحياء الجزيئي
- الكيمياء الفيزيائية والنظرية
- نُشرت المراجعة
- خادم المسودات البحثية الأولية
- bioRxiv
-
Karson Chrispens وIsaiah Hazelwood وJames Fraser راجعوا Have protein-ligand cofolding methods moved beyond memorisation? - النظرية الحاسوبية والرياضيات
- كيمياء المواد
- علم الأحياء الجزيئي
- نُشرت المراجعة
- خادم المسودات البحثية الأولية
- bioRxiv
-
Karson Chrispens وStephanie A. Wankowicz وJames Fraser راجعوا Boltz-2: Towards Accurate and Efficient Binding Affinity Prediction - نُشرت المراجعة
- خادم المسودات البحثية الأولية
- bioRxiv
-
Nikhil Gupta وJames Fraser و2 مؤلفين آخرين راجعوا Oligomerization enables the selective targeting of intrinsically disordered regions by small molecules - علم الأحياء الجزيئي
- نُشرت المراجعة
- خادم المسودات البحثية الأولية
- bioRxiv
-
Isaiah Hazelwood وJames Fraser وWillow Coyote-Maestas و1 مؤلف آخر راجعوا Energetic and structural control of polyspecificity in a multidrug transporter - الكيمياء الفيزيائية والنظرية
- علم الأحياء الجزيئي
- نُشرت المراجعة
- خادم المسودات البحثية الأولية
- bioRxiv
-
Karson Chrispens وJames Fraser راجعوا InterPLM: Discovering Interpretable Features in Protein Language Models via Sparse Autoencoders - الذكاء الاصطناعي
- علم الأحياء الجزيئي
- نُشرت المراجعة
- خادم المسودات البحثية الأولية
- bioRxiv
-
James Fraser وRishav Mitra وPriyanka Bajaj راجعوا Computational enzyme design by catalytic motif scaffolding - علم الأحياء الجزيئي
- نُشرت المراجعة
- خادم المسودات البحثية الأولية
- bioRxiv
-
CJ San Felipe وJames Fraser وJessica Flowers راجعوا Heterogeneity in ligand-bound TRPV1: A comparison of methods in cryo-EM and molecular dynamics simulation - الأجهزة الحسية
- الهندسة الميكانيكية
- الكيمياء الفيزيائية والنظرية
- نُشرت المراجعة
- خادم المسودات البحثية الأولية
- bioRxiv
-
James Fraser وJessica Flowers و1 مؤلف آخر راجعوا Seeing Double: Molecular dynamics simulations reveal the stability of certain alternate protein conformations in crystal structures - كيمياء المواد
- علم الأحياء الجزيئي
- نُشرت المراجعة
- خادم المسودات البحثية الأولية
- bioRxiv
-
James Fraser وziyue zou راجعوا Effects of residue substitutions on the cellular abundance of proteins - علم الأحياء الجزيئي
- كيمياء المواد
- نُشرت المراجعة
- خادم المسودات البحثية الأولية
- bioRxiv
-
James Fraser راجع Probing the modulation of enzyme kinetics by multi-temperature, time-resolved serial crystallography - كيمياء المواد
- علم الأحياء الجزيئي
- نُشرت المراجعة
- خادم المسودات البحثية الأولية
- bioRxiv
-
James Fraser راجع Bioorthogonal labeling of chitin in pathogenic Candida species reveals biochemical mechanisms of hyphal growth and homeostasis - الأمراض المعدية
- الكيمياء العضوية
- علوم الأغذية
- نُشرت المراجعة
- خادم المسودات البحثية الأولية
- bioRxiv
-
James Fraser وAvi J. Samelson راجعوا Massively parallel genetic perturbation reveals the energetic architecture of an amyloid beta nucleation reaction - علم وظائف الأعضاء
- علم الأحياء الجزيئي
- نُشرت المراجعة
- خادم المسودات البحثية الأولية
- bioRxiv
-
James Fraser وJessica Flowers و1 مؤلف آخر راجعوا Unveiling Cas8 Dynamics and Regulation within a transposon-encoded Cascade-TniQ Complex - علم الأحياء الجزيئي
- علم الأحياء الخلوي
- نُشرت المراجعة
- خادم المسودات البحثية الأولية
- bioRxiv
-
James Fraser وLuisa Vasconcelos وLiyi Cheng وSamantha Lish وS. Chan Baek وLang Ding وAlexandra Probst وNaiya Phillips وWilliam Grubbe وYouchen Guan و2 مؤلفين آخرين من HHMI Transparent and Accountable Peer Review Training Program راجعوا Virion morphology and on-virus spike protein structures of diverse SARS-CoV-2 variants - الأمراض المعدية
- علم البيئة
- نُشرت المراجعة
- خادم المسودات البحثية الأولية
- bioRxiv
-
Christian Macdonald وJames Fraser وDavid Byun وJeffrey Zheng راجعوا The herbicide acetochlor causes lipid peroxidation by inhibition of glutathione peroxidase 4 - علم الأحياء الجزيئي
- علوم النبات
- نُشرت المراجعة
- خادم المسودات البحثية الأولية
- bioRxiv
-
Christian Macdonald وJames Fraser وIvan Chavez وDani Rodea وAshraya Ravikumar راجعوا Decoding the Cure-all Effects of Ginseng - علم الأحياء الجزيئي
- علم الأدوية
- طب المسنين وعلم الشيخوخة
- نُشرت المراجعة
- خادم المسودات البحثية الأولية
- bioRxiv
-
Christian Macdonald وJames Fraser وIlayda Alkislar وNicholas Freitas راجعوا Deep Boosted Molecular Dynamics (DBMD): Accelerating molecular simulations with Gaussian boost potentials generated using probabilistic Bayesian deep neural network - علم الأحياء الجزيئي
- الكيمياء الفيزيائية والنظرية
- نُشرت المراجعة
- خادم المسودات البحثية الأولية
- bioRxiv
-
Stephanie Wankowicz وLena Bergmann وJames Fraser راجعوا The mineralocorticoid receptor forms higher order oligomers upon DNA binding - الغدد الصماء والسكري والتمثيل الغذائي
- علم الوراثة
- علم الأحياء الجزيئي
- نُشرت المراجعة
- خادم المسودات البحثية الأولية
- bioRxiv
-
Christian Macdonald وJames Fraser راجعوا The conserved protein CBA1 is required for vitamin B 12 uptake in different algal lineages - علم الأحياء الجزيئي
- طب الروماتيزم
- علوم النبات
- نُشرت المراجعة
- خادم المسودات البحثية الأولية
- bioRxiv
-
Christian Macdonald وJames Fraser وZhengya Liu وCatherine Shin راجعوا Phosphorylation of pyruvate dehydrogenase marks the inhibition of in vivo neuronal activity - علم الأعصاب الخلوي والجزيئي
- علم النفس الاجتماعي
- علم الأعصاب المعرفي
- نُشرت المراجعة
- خادم المسودات البحثية الأولية
- bioRxiv
-
Christian Macdonald وJames Fraser وSonya Lee راجعوا Higher-order epistasis creates idiosyncrasy, confounding predictions in protein evolution - علم الوراثة
- علم الأحياء الجزيئي
- نُشرت المراجعة
- خادم المسودات البحثية الأولية
- bioRxiv