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Investimentos em Ciência, Tecnologia e Inovação (CTI) são essenciais para o desenvolvimento econômico e social de países e regiões, e a forma de organização dos sistemas nacionais de fomento influencia o conteúdo e a qualidade da pesquisa produzida. No cenário brasileiro a literatura científica sobre as agências de fomento é escassa e dispersa, sendo necessário avançar a compreensão das relações entre as políticas de CTI, a atuação das agências e os efeitos sobre a pesquisa. Com o objetivo de identificar, descrever e analisar as publicações sobre a atuação do Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq), agência de fomento à pesquisa com um papel central no sistema brasileiro, realizou-se uma revisão bibliográfica na base Scopus. Foram incluídas 90 publicações e analisadas as informações sobre o escopo, objeto de análise e variáveis utilizadas em cada publicação. Observou-se um foco excessivo na produção científica dos pesquisadores selecionados para apoio, sobretudo os bolsistas de Produtividade em Pesquisa, com poucos trabalhos analisando os efeitos dos programas e ações da instituição. Novos estudos precisam avançar na compreensão sobre o papel das agências de fomento dentro do sistema nacional e sobre os efeitos e impactos dos modelos de fomento à pesquisa.