O Transtorno do Espectro Autista (TEA) é uma condição do neurodesenvolvimento humano complexo com prevalência crescente, cujo diagnóstico precoce permanece desafiador, especialmente em países de baixa e média renda como o Brasil, onde estudos moleculares são escassos. Este estudo piloto investigou a expressão salivar de quatro microRNAs (miR-23a-3p, miR-140-3p, miR-151a-3p e miR-486-3p) em 45 adultos brasileiros (24 com TEA e 21 controles neurotípicos), utilizando RT-qPCR e análises bioinformáticas de enriquecimento funcional e predição de alvos gênicos. Os resultados demonstraram superexpressão significativa de miR-23a-3p (FC=28.8 vezes; p=0.0012), miR-140-3p (p=0.0352) e miR-486-3p (p=0.0352) no grupo TEA, e a coexpressão entre estes. O miR-23a-3p apresentou a melhor acurácia diagnóstica (AUC=0.827; especificidade=100%), enquanto o miR-486-3p apresentou expressão diferencial associada ao ano do diagnóstico (p=0.012). Observou-se correlação muito forte entre a expressão de miR-23a-3p e miR-151a-3p (ρ=0.973) e coregulação de alvos gênicos entre tecidos de glândula salivar, córtex pré-frontal e hipotálamo. Análises de enriquecimento revelaram associação dos alvos gênicos com processos centrais ao neurodesenvolvimento, incluindo desenvolvimento do prosencéfalo e telencéfalo, cognição, comportamento social, plasticidade sináptica e ciclo vesicular sináptico. Esses achados fornecem novas evidências da desregulação de microRNAs salivares em adultos brasileiros com TEA, um grupo demográfico notavelmente sub-representado na pesquisa molecular sobre autismo. Em conjunto, as evidências indicam que microRNAs específicos envolvidos na regulação sináptica estão desregulados no TEA e destacam o potencial da saliva como um biofluido não invasivo e acessível para a triagem molecular em transtornos do neurodesenvolvimento.