A modalidade para contratualização hospitalar no SUS teve início em 2004, com o Programa de Reestruturação dos Hospitais de Ensino. Este estudo avaliou a qualidade da assistência e gestão de um hospital de ensino, sob a modalidade de convênio de gestão, com a Secretaria de Estado da Saúde de São Paulo. É um estudo de caso único, com abordagem por métodos mistos de pesquisa utilizando indicadores da qualidade da assistência e da gestão (acesso, efetividade e eficiência) e entrevistas com integrantes das comissões de avaliação do convênio. Utilizou-se a estatística inferencial pela técnica de análise de Séries Temporais Interrompidas para os dados quantitativos e análise de conteúdo para dados qualitativos, comparando-os após a implantação do novo modelo, por meio do método da fusão para a integração. Dos nove indicadores quantitativos, sete apresentaram tendência de melhora, dois em nível de significância; dois tendência de piora, um em nível de significância. Os dados qualitativos mostraram melhora na efetividade da gestão, sem haver melhora nas demais subdimensões. A análise integrada dos dados sugere que a implantação da modalidade de convênio de gestão com a SES-SP não trouxe mudanças significativas na qualidade da assistência à saúde ou na gestão hospitalar.